园区注册和市区注册的区别主要有以下几点：
1、注册地址不相同（也就是营业执照上的地址不同）
这不是开玩笑的一句话，而是影响到你初期投资、公司形象、可能的罚金等重大题目。
1.1注册地址：“市区”.VS.“园区”初期投资
获胜者：园区
原因：园区价格便宜
在市区注册公司，一般都需要客户自己提供注册地址。北京市规定，一定要房产证上写着“商用”“写字楼”“综合”“店展”等字样才被工商局接受，因此在市区注册公司，你要先租一个写字楼。这个用度一个月至少不会低于4000元。
在园区注册，注册地址都是由各个产业园区免费提供的，客户无需对此付一分钱。
——（但以上关于地址的表述是针对一般类型的贸易、咨询公司而言的，假如是想成立进出口公司或是需要场地实际检查的公司，则没有选择，客户必须注册在市区。）
1.2注册地址：“市区”.VS.“园区”公司形象
获胜者：市区
原因：市区形象好
在市区注册公司，一般是***路***号，给客户的感觉较好，在外地竞标时地址也是一个筹码。
在产业园区注册的公司，很多情况下，都会有松江***路***号或是嘉定产业园***xx路***号，一般来说没有太大影响，但假如客户对此有特殊要求的，那就建议在市区注册了。
2、征税方式不同
“市区”.VS.“园区”征税方式
获胜者：平局
原因：计算方式不同，各有优劣
市区的公司一般都是采取“查账征收”的方式来收税，而园区则采取“代征”的方式来收。不过从2007年起，很多园区开始逐渐取消代征的方式，目前只有少数园区可以代征。
用简单的话来解释这两种税收的不同：假如您从事的是一般的贸易活动，营业额一年100万，利润为20万。在市区，您要交的税是5％的营业税，就是5万。同时要交20×33％＝6.6万为所得税。在园区，您要交5％的所得税，以及100×0.6＝6万元的所得税。由此可见，营业税的算法两地是一样的，但所得税的算法截然不同。市区会根据（收进－本钱）×33％来计算所得税，园区会给一个固定的比例，直接用营业额×此固定比例即可。
3、税务培训、购买发票、报税不同
“市区”.VS.“园区”方便
获胜者：市区
原因：市区办事方便
市区，无论税务培训、购买发票、报税、年检都是在本区进行，很方便。
园区，税务培训、购买发票、年检都是在园区进行的。好在每个园区在市区都有报税点，每个月都可以在市区较为方便的报税。
4、初期成立本钱
“市区”.VS.“园区”成立本钱
获胜者：平局（园区略为便宜些）
拿注册一家50万注册资金的公司比较：
市区：1、需要出50万资金2、政府收费2000元RMB左右3、会计验资费1000元4、本公司代理费2500左右，合计5500元
园区：1、无需出50万资金2、园区收费和本公司代理费合计10000元左右。或者在园区我们也建议客户自己出注册资金，这样的用度就和市区一致了。由于园区可以省下租赁地址的钱，因此，园区会更便宜些。
5、返税
“市区”.VS.“园区”返税
获胜者：园区
原因：园区略高市区
园区返税固然略高于市区，但差别不是很大，市区也有部分情况下返税。园区的返税在某些情况下有一定的限制。
6、公司正当性经营风险
“市区”.VS.“园区”正当性------可持续性------风险
获胜者：市区
原因：市区注册资金、经营地址都更为正当
总结：
假如您有以下几种情况，建议您注册在市区，否则建议在园区注册。
一、对公司正当性有特别高的要求，欲长治久安
二、可以全额支付注册资金
三、已租赁好办公写字楼，并想以此地址为办公地址的
五、不想往很远的园区跑
四、欲成立进出口公司或是申请一般纳税人资格，以及需要实地注册的公司类型。
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