分公司不行，子公司可以，因为分公司没有资格单独申请高新技术企业认定的资格，但是可以与总公司共同享受税收优惠，子公司是具有独立法人资格的，因此只要符合《高新技术企业认定管理办法》中的相关要求，就可以单独申请高新技术企业的认定，且成功认定后同样能享受到税收优惠。
已认定的高新技术企业有下列行为之一的，由认定机构取消其高新技术企业资格：
1、在申请认定过程中存在严重弄虚作假行为的；
2、发生重大安全、重大质量事故或有严重环境违法行为的；
3、未按期报告与认定条件有关重大变化情况，或累计两年未填报年度发展情况报表的。
对被取消高新技术企业资格的企业，由认定机构通知税务机关按《税收征管法》及有关规定，追缴其自发生上述行为之日所属年度起已享受的高新技术企业税收优惠。
第二十条 参与高新技术企业认定工作的各类机构和人员对所承担的有关工作负有诚信、合规、保密义务。违反高新技术企业认定工作相关要求和纪律的，给予相应处理。
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