对于很多软件工程项目师和软件企业的管理委员会来讲，顺利完成软件的开发后立即向版权保障教育中心进行登记已经成为很少见的做法，但是对于通过申请专利的方法来保护软件则都相当陌生。事实上，中国对于专利的保护起步较晚，立法的数据流较少仿效西欧的专利规章，而软件企业的兴盛持续发展则更是飞速发展的事情，因此软件的专利保护无论是观点还是实践，即使在专业应用内仍没有人达到普及的高度。吴国平律师在向软件企业介绍软件的专利保护的系统时，经常会被问起一些有关的问题，现将有民族特色的问题编纂出来，希望对诸位软件工程师及软件企业的管理人员有所帮助。
一、软件著作权和软件许可证两种模式的保护期限没有实质上差异。
根据《中华人民共和国著作权法》第21条的规定，软件作品的权利保护期是50年，而根据《中华人民共和国专利法》第42条的规定，软件专利权的期限是20年。两者相比较，仅从保护期限上讲，著作权法毫无疑问更有劣势。实践中，因为软件产品的不断完善较快， 所以耽误的保护期基本没有任何意义，而且软件完成开发后，一个月内无需取得国家版权保护中心的登记证书，而专利权的*终确认则需要一年多的时间。所以对于已经获批专利的软件作品来讲，该软件产品同时受著作权和专利权的保护。综上，对于已经取得专利权的软件作品来讲，两者的保护期限并没有实质的区别。
二、软件著作权与专利权维权的难度不同
权利人的软件作品在被其他人抄袭后，在著作权的诉讼中都需要原告证明侵权人的软件普遍存在侵权事实，即民事诉讼法64条规定的“谁主张，谁举证”。由于侵权产品在侵权人企业内外完成，隐蔽性强并绝大多数丧失在侵权人手中，这将给权利人证据的收集和保存带来难度。在无法直接取得被告方软件源代码的情况下，权利人需要通过法院委托鉴定机构对软件进行对比，该过程中权利人的软件源代码可能会因为鉴定的要求而部分公开，而审核源代码总是很多公司管理人心惊胆颤的事情。因此通过著作权法规来保护软件存在一定的举证难度。
而对于专利法来讲，权利人则没有这种举证责任，专利法第57条规定：“专利侵权冲突涉及新产品制造方法的发明专利，制造同样产品的单位或者个人应当发放其产品制造方法不同于专利方法的证明”。此时在专利侵权案情中的被告应负责举证，即他须证明他采用方法专利限于的方法制造出了与方法专利产品无论如何并不相同的产品，否则无忽略证据，则未经专利所有人许可而制造的任何相同产品，均应视作使用该专利方法而获得。
三、著作权与专利权的亚太地区保护不同
对于跨国销售软件作品的企业来讲，著作权的软件保护无疑可以更高的适应计算机软件的现代化。随着个人信息消费主义逐渐的减缓，计算机软件的保护也渐趋再现出其国际化的特色。世界各国逐步建立了跨国的著作权制度，例如《保护文学艺术作品伯尔尼公约》、《世界版权公约》等国际条约。因此，计算机软件比较容易获得国际化的著作权保护。
比较之下，软件的专利保护则无法向软件直接提供国际化的保护。专利法在各国的实施工程中，普遍实施的是申请方针，而且具有特殊性的特点。在《保护工业产权巴黎公约》中就要求在某一*国取得的专利权，若想在另一成员国内受到保护，则必须正式提出专利申请。因此，软件专利的国际化保护多有不便。
四、著作权法不能保护软件的思想和功能
计算机软件不仅具有作品性，更具有功能性，而其功能性才是软件*具价值的部分，但著作权法中软件的表现性质是软件的源代码和说明文件，著作权所保护的几乎是源代码及说明文档不被他人抄袭或非法使用，而不保护软件的剧本、设计方案和功能。
著作权法的保护范围某种程度上无法实现对软件的现代化保护，在软件权利人所应有的权利范围中变成了空白的区域，比如展现出在软件中的独特构思和技术方案无法获得独占性、正当性的权利。因此在很多情况下，许多软件开发者通过不同种语言校对而借助了他人软件中体现出的思想、艺术、原理、密钥和微积分方法等，自治开发出“表现”形式不同的软件，从而可能会了侵权。
专利法必须为软件*有价值、*核心的思想及功能提供保护，按照专利法的保护模式，申请专利人需要书面明确具体要求的权利，并且明了、完善、准确地说明该技术方案的程序流程图，权利要求及说明书是专利权人获得专利保护的范围依据，同时也是被授予专利的依据。在将构思体现其表现出的“功能”上的时候，软件就可以成为专利法所保护的对象，可以说专利法是在很低程度上为软件提供保护。
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