经营所得个人所得税退税申请的程序是：提交退税材料、填写申请表、税务机关审查、核实相关情况、办理退税等，对于个人所得税的具体退税情况，应当严格按照上述规定的程序来进行办理。
符合规定享受减免税优惠的个人，应对照减免税政策和减免税项目，在发放个人工资薪金前，向财务处提交减免税申请及相关资料。
申请享受减免税优惠的个人，应提供的资料主要包括：
1.申请人本人签名的享受减免税优惠的申请原件;
2.本人有|效证件(身份证、护照等)复印件;
3.与申请减免税项目直接相关的文件、证书、证件复印件，如批准为高层次人才的文件、证书，获省级政府以上单位以及外国组织、国际组织颁发奖金的文件、证书，享受政府特殊津贴的专家、学者的文件、证书等;
4.其他相关资料,如本人应取得相应收入的证明、合同、协议等资料，与减免税项目相关的资料。
财务处收到个人提交的减免个人所得税申请及相关资料后，经初步检查并汇总当月减免个人所得税的申请，拟订公司当月办理减免个人所得税申请并整理完善有关资料，经领导审批、加盖公章后报主管税务机关办理。
经主管税务机关核实，符合享受减免个人所得税优惠的，向公司出具未盖公章的税务事项通知书和纳税人减免税备案表，经公司法人签字、加盖公司公章后，送主管税务机关盖章。
管税务机关出具的税务事项通知书和纳税人减免税备案表盖章，个人所得税减免税备案手续完成。财务处及时将税务事项通知书和纳税人减免税备案表在OA系统和财务处网站公开。
申请人在OA系统或财务处网站查看到减免税备案完成的通知后，可持报销所需的相关材料到财务处办理报销领款手续。
1.在申请人办理完报销领款手续的次月，财务处将在税务局的个人所得税纳税申报系统中，为个人进行该项减免税事项的纳税申报。
2.根据《中华人民共和国个人所得税法》及其实施条例和《个人所得税自行纳税申报办法(试行)》规定，在一个自然年度，凡取得工资薪金所得等收入累计达到12万元以上(以当年税务通知的金额为准)的个人，应于次年3月31日前办理个人所得税网络纳税申报。
当年办理减免个人所得税优惠手续的收入事项，申请人届时应自行按政策规定进行减免税的纳税申报。
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