货物随运费销售的问题

老师，我们公司的货是随运费销售的，是代垫的然后和客户结算，但我们开的是13的发票，我们营业执照上无运输业，也不是运输企业，这样，我们就比较吃亏，因为运费公司开给我们的运费是9，我们是13，刚才你说可以在合同上分开列示，并可以由运费公司开，那是说我们开货物的发票加运输公司的发票一起和客户结算？合同上又怎么分开列货物和运费？因为是我们和客户订的合同，运费发票又是运输公司开的