个人独资企业的银行没有进帐，但发票开出了怎么做帐呢？

我们公司今年从个体工商户变成了个人独资企业，公司的开票量很大，现在我们向客户开几万元的发票，用这家公司的账户开。但是客户的钱不在公司的账户上，这个账怎么办？